情報システム部は、ＩＴを利活用した都民サービスの向上・業務の効率化に取り組むとともに、区市町村等と連携した電子自治体の構築や地域情報化の推進を行うなど、東京都全体の高度情報化の推進を担っています。また、こうした高度情報化を支える庁内ネットワーク及び共通基盤システムなどの保守・運用管理、技術支援、ＩＴ人材の育成などを行っています。

平成２２年３月には、都の情報セキュリティポリシー等に基づく対策をより確実に実施するべく、ＩＳＯ規約に基づくＩＳＭＳ（情報セキュリティマネージメントシステム）の認証を受けました。